目前Ubuntu18.04官方源已经内置bwa，直接使用apt即可安装：
1 | sudo apt install bwa |
以下介绍使用源码编译安装
首先安装依赖：
1 | sudo apt install zlib1g-dev |
然后安装git用来下载源码：
1 | sudo apt install git |
安装成功后下载源码：
1 | git clone https://github.com/lh3/bwa.git |
进入目录并编译：
1 | cd bwa; make |
编译成功后使用 ./bwa 即可使用。
以后使用的话可以将bwa复制到所在目录使用./bwa运行，或者每次都用bwa的绝对路径运行，如/root/bwa/bwa
上面两种方法用起来都不方便，还是直接加到系统软件里比较方便：
1 | sudo cp /root/bwa/bwa /usr/local/bin/bwa |
注意上面的/root/bwa/bwa要改成你电脑里bwa的位置
以后就可以在任意路径下用bwa指令了。
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